L'étude du fait religieux s'organise autour de trois axes :
• Une sensibilisation : grâce à une réflexion sur le concept de « fait religieux », elle permet aux  enseignants (1^er et 2^nd degré) de repérer  dans les programmes scolaires les lieux où le fait religieux doit être pris en compte. Elle les amène à  prendre conscience de la nécessité de formation de chacun au sein de toutes les disciplines.

• Des journées d'études : elles sont destinées  à l'ensemble des enseignants déjà  sensibilisés à l'étude du fait religieux. A partir d'apports  universitaires, elles ouvrent à  une réflexion sur les pratiques pédagogiques de chacun. Elles aboutissent à des productions par groupes disciplinaires et transdisciplinaires.

• Un diplôme universitaire de niveau 2 « pédagogie et religions » : il s'adresse à des personnes titulaires d'une licence voulant parfaire leurs compétences dans le domaine de la pédagogie du fait religieux et désireuses de développer une recherche dans ce domaine.